27 Мар, 2024

Стартует международный конкурс IBIS

Стартует международный конкурс IBIS (Inference of Binding Specificities, определение специфичности узнавания)

Организаторами является команда ученых из нескольких стран, в том числе среди них два члена экспертного совета магистратуры — Иван Кулаковский и Всеволод Макеев

В ходе конкурса будет определен алгоритм, который лучше всего справляется с задачей предсказания паттернов в последовательностях ДНК, узнаваемых специальными белками — факторами транскрипции.

Победившая команда будет в числе соавторов в научной публикации в высокорейтинговом журнале. 

Несмотря на то, что множество лабораторий по всему миру изучают вопрос транскрипционных факторов, так как аномалии, связанные с их регуляцией ассоциированы с серьезными заболеваниями, до сих пор отсутствуют современные бенчмарки программ по предсказанию последовательностей связывания транскрипционных факторов, тестовые данные из которых не были бы известны на момент разработки тестируемых методов;

Также плохо решена задача переноса предсказаний между различными видами экспериментов (оценивающими связывание для «природных» последовательностей из генома человека или для случайных последовательностей).

 «IBIS должен решить обе проблемы – за счет новых и разнообразных данных для транскрипционных факторов, о которых ранее не было ничего известно, и за счет честного независимого сравнения простых классических и сложных современных моделей»

пишут организаторы конкурса.

Другие новости